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上海宇玫博生物科技有限公司位于国家级高新技术园区——上海张江高科技园区,公司成立于 2015 年 10 月,是国内较早开展外泌体和基因编辑研究、服务及相关试剂开发的专业公司之一,现已发展为专业化科研服务及试剂方案的供应商。「推动转化医学,服务人类健康」是宇玫博的公司宗旨。公司拥有先进的仪器设备,一流的研发团队,对每一项服务和产品都进行严格的测试检验。自创立以来,宇玫博始终坚持科学管理、规范操作、用户至上的企业经营理念,力争早日将公司发展成为国内转化医学行业中的佼佼者。 宇玫博拥有外泌体和基因编辑领域的多项专利及软件著作权,具有外泌体研究方向一系列的科研试剂产品,并且擅长无血清、化学成分界定、个性化及定制化细胞培养基和细胞培养工艺的开发。宇玫博以市场为导向,以知识产权为依托,产品研发与科研服务并进,通过技术创新、产品研发和科研服务三个方面为客户提供全面完整的生命科学研究解决方案,同时实现公司的市场增值及快速发展。 产品优势:外泌体提取试剂盒涵盖组织、细胞上清、血清血浆、乳液、尿液以及其他体液等多种样本;● 针对不同样本,预处理、提取、纯化试剂做差异化配方;● 样品处理量大,可达同类产品 5 倍以上;● 外泌体可用于细胞共孵育和组学研究;● 专注于外泌体提取和配套试剂盒研发;● 价格便宜,为您大规模研究节省成本;● 数百篇参考文献让您放心使用无忧购;服务优势:● 经验丰富,做外泌体研究早,近 10 年的研究经验积累;● 案例丰富,接触的样本类型很多,能针对性的进行操作;● 专心专注,只做外泌体领域,始终坚持外泌体深度研究;● 独立自主,从提取到鉴定,检测及后续研究,独立完成;● 诚信做事,完善的数据记录体系,实验结果经得起考验。
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CELL:利用蛋白质组学发现多种肿瘤诊断及分类的外囊泡标志物

人阅读 发布时间:2020-12-09 16:37

组织活检是现阶段癌症诊断的最主要手段之一。而体液活检由于其创口小,易连续获取及可在早期诊断癌症的特点,逐渐成为研究热点。而细胞外囊泡(EVPs)又是体液活检的主要材料来源而备受关注。EVPs是一种胞内来源,直径在30–150 nm的囊泡结构,内部富含核酸,脂质和蛋白质等物质可作为肿瘤的生物标志物,具有巨大的研究和应用潜力。

纪念斯隆•凯特琳癌症中心和康奈尔大学等单位合作,共同发现肿瘤释放的细胞外囊泡称为EVP,可以用于在早期阶段诊断及分类多种不同类型的癌症。该成果于2020年8月20日发表在Cell(IF=38.6)杂志上,题目为“Extracellular Vesicle and Particle Biomarkers Define Multiple Human Cancers”。

研究材料
健康人及肿瘤患者的组织、血浆、及其他液体样本来源的外囊泡及颗粒

技术方法
Label free蛋白组及PRM靶向蛋白组

实验结果
7种不同来源的细胞外囊泡蛋白质组学分析及生物标志物的确定
作者选取了497例鼠源样本,使用超速离心法提取EVPs,并进行定量蛋白质组分。这497例样品中,有426例是人源,71例鼠源;包含组织、细胞,也有血浆、血清等体液。通过对各种不同样品的相关性分析,作者发现:体液来源的样品相互之间较为相似,而同组织来源的样品数据差别显著。而通过进一步分析,不仅确认了传统的EVP标记物CD9 、HSPA8、ALIX和HSP90AB1,还发现了潜在的EVP标记物,ACTB、MSN和RAP1B。此外,相关性分析还表明人类和小鼠之间的蛋白差别较大,这意味着我们不能单纯依靠小鼠模型来指导人类的液体活检标志物。因此,在后续的分析中,作者着重从人类组织和体液来源的EVPs中分别寻找相应的生物标志物组合。

组织类样品来源的EVPs标志物分析
作者比较了肿瘤组织和癌旁组织及健康组织的EVP蛋白质组。利用随机森林模型对151例样本中的75%作为训练集进行学习,剩下的25%作为验证集。最终确定16个蛋白质的队列用作癌症诊断标志物,可达到95%的敏感性和92%的特异性。



体液类样品来源的EVPs标志物分析
作者比较了体液来源的EVP样本,使用随机森林分析方法,对120个体液类样品进行训练学习。最终得到了47个蛋白质队列,其在训练集中的敏感性和特异性分别达到100%和82%,在测试集中的敏感性和特异性分别达到95%和90%。

组织和体液来源的EVPs标志物对不同癌症类型指征。
作者通过随机森林聚类和t-SNE分析,可有效对不同类型的样本进行区分。结果表明,无论组织来源还是体液来源EVPs的蛋白均有助于判断具体的肿瘤类型。并可诊断一些 “原发位置不详的肿瘤”。可根据血浆中EVP携带的特征性蛋白,对这些肿瘤做出分类。

结论
通常病理学家利用组织活检来诊断癌症,而液体活检具有创口小,可连续获取的特性逐渐成为病理诊断的“热门”。 目前还有一些癌症没有有效的筛查方法可以及早发现,例如肝癌和胰腺癌,希望这类新型的检测方法可以为其诊断提供帮助,做到早发现,早治疗,把癌症扼杀在萌芽之中。


参考文献:
Extracellular Vesicle and Particle Biomarkers Define Multiple Human Cancers. Cell. 2020 Aug 20;182(4):1044-1061.e18. doi: 10.1016/j.cell.2020.07.009. Epub 2020 Aug 13.

 

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