上海宇玫博生物科技有限公司
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宇玫博
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上海 浦东新区
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技术服务、耗材、实验室仪器 / 设备、细胞库 / 细胞培养、论文服务、试剂、原辅料包材
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公司新闻/正文
SNP 序列查询 SOP
人阅读 发布时间:2019-04-10 15:47
1、SNP 序列查询
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/
2、搜索目的 SNP 位点:(rs114234235 为例)
3、搜索结果
4、点击查看明细
5、SNP 明细信息:
6、获取 SNP 上下游序列:
>gnl|dbSNP|rs114234235|allelePos = 201|totalLen = 401|taxid = 9606|snpclass = 1|alleles ='A/C'|mol = Genomic|build = 151
GGGAGGGGGT CTCAGGGGAG GAAGGGCAGC TCTAATTGGT TTCTCAATGA AAGATAATCA
CCTACTCCCC AGAGAGGCTG GAGATTAGCA CTCTGCCTCT CCTCTCCATC GCTTTTAGAC
TTCTCATCCT CCCCTCGGTG CTTTTAGTCC ATTCAGCAGA AGCGGATCGA AGCAGGAGGC
TCCCCGCGCC GCATTAGGGG
M
GCACTCCGCC GCGCTCGAGT ACTTAGCGCC CATTCACTCG CTCACCCGCG CTCTCCGCTG
CCGGCTGCCG TCCCAGCCGC CGCCGCCGCC GCCGCCGCCG CCGCCGCCCG AGAAAAAGTT
TCGCGGAGGG GCTCAGTGAA AAAATGAGCG AGCTAGAGGA AGACTTTGCC AAGATTCTCA
TGCTCAAGGA GGAGAGGATC
7、在 SNP 对应基因中进行比对
rs114234235 位于 PRKG1 基因的启动子区域;